לימודים לתואר הנדסאי ביוטכנולוגיה ברשת מכללות אורט נועדו להכשיר את הסטודנט לעסוק בתחום הביוטכנולוגיה, בו מיושמות טכנולוגיות הנדסיות מתקדמות. תוכנית הלימודים מקנה לבוגר המסלול ידע בין תחומי רחב ומאפשרת לו לעסוק במגוון נושאים בתחומי המחקר.
לימודי ביוטכנולוגיה הינם לימודים מורכבים ועתירי ידע, בהם מיושמות טכנולוגיות הנדסיות מתקדמות במטרה להפיק תועלת לאדם. התעשיה הביוטכנולוגית הינה תעשייה רב תחומית וחדשנית המלווה במחקר עדכני בתחומים כגון רפואה וחקר מחלות מההיבט הגנטי, חקלאות, פיתוח זנים חדשים, תעשיית המזון, פיתוח מוצרים חדשים, הדברה ביולוגית, אצות וצמחים, הנדסת מזון, ביוטכנולוגיה סביבתית ועוד. בוגר התוכנית ישתלב במפעלים ביוטכנולוגיים, בחקלאות, בתעשיית המזון, במעבדות מחקר, בשוק התרופות ובמסגרות נוספות.
תוכנית הלימודים נוגעת בתחומים כגון כימיה, מיקרוביולוגיה, ביוכימיה, הנדסה גנטית, אימונולוגיה, דיאגנוסטיקה, מכשור ובקרה, מיקרוביולוגיה תעשייתית, טכנולוגיה של מזון, ביוטכנולוגיה בחקלאות ועוד. הלימודים נמשכים שנתיים ומתקיימים במתכונת של לימודי יום. בפני סטודנטים הלומדים במסלולי ההנדסאים בשנה השנייה או השלישית ללימודיהם (בהתאם למסלול - יום או משולב) קיימת אפשרות השלמה לתואר B.A במדעי החברה.
חיילים משוחררים עד 5 שנים מתאריך השחרור, זכאים בשנה א' להנחה בשיעור 90% משכר הלימוד היסודי בכל מסלולי ההנדסאים ובשנה ב' להנחה בשיעור עד 90% משכר הלימוד במסלול הנדסת ביוטכנולוגיה. כמו כן, זכאים חיילים משוחררים לממן את הלימודים ע"ח הפיקדון האישי בכפוף להנחיות מה"ט. הלימודים מתקיימים במכללת אורט בראודה בכרמיאל.