כימיה תרופתית עוסקת בפיתוח, ייצור ומתן של תרופות המשמשות לטיפול מונע, ריפוי והקלה של תסמיני מחלה. כימאים תרופתיים מאתרים תרופות חדשות או משפרים תרופות קיימות, ובנוסף, דרישות ה- FDA הובילו את הכימאים התרופתיים לעסוק כיום גם בפיתוח ושיפור של שיטות אנליטיות לבדיקה כימית של תרופות בגוף ולבדיקת אורך חיי המדף שלהן.

לימודים במסלול מתקיימים במתכונת של לימודי יום ונפרשים על פני שנתיים. בין נושאי הלימוד ניתן למצוא כימיה כללית ואנאליטית, כימיה אורגנית, אנטומיה, פיזיולוגיה, גנטיקה, ביולוגיה, פרמקולוגיה ועוד. בוגרי המסלול, אשר ימצאו מתאימים, יוכלו להמשיך לתואר ראשון (B.Sc) במסלול פארמה הקיים במחלקה לביוטכנולוגיה במכללת אורט בראודה.

בפני סטודנטים הלומדים במסלולי ההנדסאים בשנה השנייה או השלישית ללימודיהם (בהתאם למסלול - יום או משולב) קיימת אפשרות השלמה לתואר B.A במדעי החברה. חיילים משוחררים עד 5 שנים מתאריך השחרור, זכאים בשנה א' להנחה בשיעור של 90%משכר הלימוד היסודי. כמו כן, זכאים חיילים משוחררים לממן את הלימודים מהפיקדון האישי, בכפוף להנחיות מה"ט. הלימודים מתקיימים במכללת אורט בראודה בכרמיאל.