היחידה ללימודי המשך מציעה תוכניות ללימודי הנדסה לקראת תואר שני, אשר מועברות ברובן בקמפוס היחידה בתל אביב.
לימודים לקראת תואר שני - מסלולי לימוד:
MBA - תואר שני במנהל עסקים
ME בהנדסת מערכות
MBA מנהל עסקים עם דגש על חברות עתירות טכנולוגיה
ME בהנדסה ביו רפואית
ME בהנדסה אזרחית - התמחות בייזום וניהול עסקי בנייה
MRE במקרקעין
M.Sc למדעים בארכיטקטורה - התמחות בשימור
לימודי הנדסה לקראת תואר שני ביחידה ללימודי המשך בטכניון מתקיימים לרוב במתכונת של יום אחד בשבוע, בשעות אחר הצהריים, דבר הנועד לאפשר שילוב של לימודים ועבודה.