היחידה מורכבת ממספר מדורים:
מדור לוט"ר – עוסק בגיבוש ובחינת תורת הלחימה הצבאית ללוחמה בטרור, והוא מכשיר את הלוחמים לירי באקדח בשילוב הדרכה והכשרה ללוחמת גובה, ואלו זיכו את לוחמיו בכינוי "קופים". למדור זה מצטרפים לוחמים בוגרי מסלול לוחמה בטרור.
מדור צלפים – במדור זה מרוכז הידע בכל הנוגע לאמצעי לחימה, תחמושת ותורת הצליפה. במדור משרתים מדריכים ומדריכות שהוסמכו לתפקד כמ"כים ומדריכות חי"ר שעברו קורס מדריכות צליפה. המדריכים במדור הינם נופלי מסלול לוט"ר או כאלו שפרשו משירות קרבי באחת מחטיבות חיל הרגלים והצטרפו לקורס ההדרכה. כמו כן, במדור זה נמצאים גם בוגרי מסלול לוחמה בטרור שאחראים על תחום צליפת לוט"ר.
מדור קליעה – במדור זה מכשירים את לוחמי צה"ל באמצעי לחימה, נשק קל, תחמושת ותורת הקליעה. החיילים במדור זה רוכשים ידע על אודות ירי ברובי סער, מקלעים ומטולי רימונים. במדור משרתים מדריכים שהפסיקו את שירותם הקרבי בחטיבת חי"ר ומדריכות חי"ר שעברו קורס מדריכות קליעה.
מדור אפ"ק – מדור זה עסק בתחילת דרכו בתחומי האבטחה, הפריצה ו"קופים" (אפ"ק), ועם הזמן נוספו לו תחומים נוספים, ביניהם: ההסוואה וטג"ח (טיפוס, גלישה וחילוץ). כיום תחום האבטחה כבר איננו פעיל, אך בעקבות מבצע "צוק איתן" הוקם תחום נוסף הנקרא – "לת"ק" שפירושו – לוחמה תת קרקעית. בשאר התחומים עוסקים לוחמי היחידה בהדרכת פריצה קרה, תורת ההסוואה, בחינת אמצעי הסוואה לשימוש עתידי בצה"ל ועוד.
