החניכים מתחילים את הכשרתם בטירונות רובאי 03 (בעלי פרופיל רפואי נמוך יעשו טירונות רובאי 02), ובתום הטירונות מגיעים החניכים למתקן ייעודי של התכנית באוניברסיטת חיפה. הלימודים נערכים במתכונת של תואר דו-חוגי, הכולל חוג בחירה (מדעי המחשב, פילוסופיה, מתמטיקה וכלכלה) וחוג המשלב מדעי המדינה, ההיסטוריה של המזרח התיכון וסוציולוגיה.
בשילוב עם הלימודים, עוברים החניכים הכשרות מודיעיניות מגוונות וייחודיות לתכנית. החניכים לומדים על דיסציפלינות המחקר המודיעיני השונות ועל כלל שיטות האיסוף המודיעיני, ביניהן סיגינט (תקשורתי), ויזינט (חוזי) ויומינט (אנושי). בנוסף, החניכים מסיירים בכלל יחידות אגף המודיעין, עוברים סדרות צבא בהן מכירים את המערכים הרבים והיחידות השונות בצה"ל ומבצעים פרויקטים מודיעיניים ביחידות מחקר שונות בכלל הדרגים.
הכשרת התכנית מתאפיינת בעצמאות המאפשרת לחניך להתפתח ולצמוח בזכות ובכוחות עצמו. החניכים חווים תהליך פיתוח אישי מעמיק המותאם לכל חניך בהתאם ליכולותיו ואישיותו, בדגש על שאיפה למצוינות והקניית בסיס ערכי רחב, תוך ליווי וחניכה צמודה מצד סגל המפקדים (כולם בוגרי התכנית). במהלך ההכשרה החניכים מתנסים בתפקידי ניהול ופיקוד שונים ובנוסף עוברים את קורס הקצינים הצה"לי (במגמת נחשון) בבה"ד 1 כחלק מהכשרתם הפיקודית.
מעבר לכך, החניכים נהנים מתנאי שירות הכוללים מימון לימודים, מחשב נייד ושיעורי עזר במקצועות הנדרשים. זאת, על מנת לאפשר את התמקדותם בהכשרה.
